Le transport aérien représente un enjeu d’ouverture pour la Région et prépondérant pour le tourisme et l’économie. À travers des conventions avec l’État, les Conseils généraux, les agglomérations ainsi que les Chambres de commerce et d’industrie, le Conseil régional participe au soutien financier des lignes déficitaires. La Région intervient aussi sur l’accès et la modernisation des aérodromes ou encore l’insonorisation des habitations riveraines de l’aéroport de Toulouse-Blagnac, programme connu sous le nom de Silencio.
Dans le cadre des obligations de service public, la Région participe au financement des lignes aériennes en déficit d’exploitation : Tarbes/Paris, Castres-Mazamet/Paris, Castres-Mazamet/Rodez/Lyon. Le maintien de ces lignes contribue au désenclavement des bassins de vie et d’activités liés à ces aéroports.
Depuis 2007, le Conseil régional Midi-Pyrénées, le Conseil général de la Haute-Garonne et la Communauté d’agglomération du Grand Toulouse détiennent, chacun, 5 % de la Société aéroportuaire de Toulouse-Blagnac aux côtés de la CCIT (Chambre du commerce et de l’industrie de Toulouse). À ce titre, la Région veille à préserver les intérêts des collectivités dans la gestion avec l’État (actionnaire majoritaire) de cet équipement majeur.
Par volonté d’aménagement du territoire mais aussi de désenclavement, la Région intervient en faveur des plateformes aéroportuaires. Trois opérations symbolisent actuellement cet engagement : la réfection de la piste et des parkings avions de l’aéroport de Tarbes-Lourdes- Pyrénées, la construction d’un nouvel aéroport à Brive-Souillac et le projet de rénovation de la plateforme aéroportuaire de Rodez.
La Région, aux côtés de l’État, intervient financièrement, depuis 2003, dans le cadre d’un programme de travaux de mise aux normes des hélistations et hélisurfaces en Midi-Pyrénées pour les transports héliportés pour les secours d’urgence. Douze dossiers ont ainsi été traités.